Высший совет является высшим коллегиальным органом управления НО «ЦФБП РС (Я)». Основной функцией Высшего совета является обеспечение соблюдения НО «ЦФБП РС (Я)» целей, в интересах которых он создан.
Состав Высшего совета определяется и утверждается Главой Республики Саха (Якутия) на срок – 3 года.
Высший совет НО «ЦФБП РС (Я)» утвержден Распоряжением Главы Республики Саха (Якутия) от 14 марта 2025 г. N 181-РГ в следующем составе:

Заместитель председателя Правительства
Республики Саха(Якутия),
председатель Высшего совета

Первый заместитель министра имущественных и земельных отношений
Республики Саха (Якутия), член Высшего совета

Заместитель начальника отдела по работе с органами государственной власти Республики Саха (Якутия) АК «АЛРОСА» (ПАО) (по согласованию), член Высшего совета

Генеральный директор некоммерческой организации “Целевой фонд будущих поколений Республики Саха (Якутия)” (по согласованию), член Высшего совета

Заместитель министра экономики Республики Саха (Якутия), член Высшего совета

Министр строительства Республики Саха (Якутии), член Высшего совета

Первый заместитель министра финансов Республики Саха (Якутия), член Высшего совета