Высший совет является высшим коллегиальным органом управления НО «ЦФБП РС (Я)». Основной функцией Высшего совета является обеспечение соблюдения НО «ЦФБП РС (Я)» целей, в интересах которых он создан.

Состав Высшего совета определяется и утверждается Главой Республики Саха (Якутия) на срок — 3 года.

Высший совет НО «ЦФБП РС (Я)» утвержден Распоряжением Главы Республики Саха (Якутия) от 3 февраля 2022 г. N 39-РГ (в ред. от 25.04.2023) в следующем составе:

Местников Сергей Васильевич
Заместитель председателя Правительства
Республики Саха(Якутия),
председатель Высшего совета
Романов Виктор Дмитриевич
Министр строительства Республики Саха (Якутии), заместитель председателя Высшего совета
Миронова Екатерина Константиновна
Заместитель министра имущественных и земельных отношений
Республики Саха (Якутия)
Хиль Елена Юрьевна
Заместитель министра финансов Республики Саха (Якутия)
Елисеев Иван Елизарович
Заместитель министра экономики Республики Саха (Якутия)
Егоров Владимир Анатольевич
Генеральный директор некоммерческой организации «Целевой фонд будущих поколений Республики Саха (Якутия)» (по согласованию)
Комаренко Алексей Сергеевич
Заместитель генерального директора акционерного общества
«Венчурная компания «Якутия»
(по согласованию)
Бравин Анатолий Дмитриевич —
заместитель начальника отдела по работе с органами государственной власти Республики Саха (Якутия) АК «АЛРОСА» (ПАО) (по согласованию)